Construído em 1896 em área da antiga chácara de Joaquim Floriano Wanderley, conhecida como Chácara Wanderley, foi reformulado pelo Escritório de Ramos de Azevedo por volta de 1910. O complexo de edifícios fruto dessa reformulação permanece até os dias atuais.
Pertencente à Irmandade da Santa Casa de Misericórdia de sua construção até o início da década de 1960, o local acolheu crianças abandonadas, cuidando delas até cerca dos 7 anos de idade. Na década de 1960, o complexo passa ao Governo do Estado que instala ali uma unidade da Fundação Estadual do Bem-Estar do Menor (FEBEM) que funcionou até a década de 1998 quando a Fundação Faculdade de Medicina (USP) adquire o conjunto de edifícios. Neste mesmo ano, ocorre o tombamento do local.